课程培训
Fiji(ImageJ Distribution)培训课程

 第一天:Fiji基础操作与图像分析入门

1. 培训导入与概述

培训目标、流程介绍与应用场景举例

FijiImageJ的关系及优势

Fiji常用功能与典型案例

2. 软件安装与主界面介绍

Fiji下载安装与启动

界面结构、菜单、工具栏简介

支持的文件格式与数据导入

3. 图像基础操作与预处理

图像打开、保存、格式转换

图像堆叠/切片管理

基本操作:缩放、旋转、裁剪、对齐

4. 图像增强与预处理

亮度/对比度调整

滤波、去噪、锐化

ROI(感兴趣区域)选择与管理

5. 测量与统计分析基础

手动与自动选择区域

长度、面积、灰度值等基础测量

结果统计与数据导出

6. 基础案例实操与答疑

显微/医学图像基础处理流程演示

本日内容总结与答疑

第二天:高级分析、批量处理与插件实战

1. 批量处理与宏录制

批处理流程(批量图像、批量测量)

宏录制与基础脚本操作

简单自动化分析实例

2. 图像分割与目标识别

阈值处理与自动分割方法对比

粒子分析与自动计数

分割参数优化与错误修正

3. 多通道和3D影像分析

多通道图像管理、分色与叠加

Z-Stack3D堆叠)操作与分析

基础3D可视化与测量

4. 插件扩展与高级工具

插件管理方法与常用插件推荐(如Bio-Formats, TrackMate, Cell Counter等)

特色插件实操演示

Fiji与其它分析/数据库工具的数据互通

5. 综合案例实训

全流程演练:如细胞计数、荧光强度分析等科研常见任务

报告输出、数据导出与图表制作




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