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GaussView 分子建模与计算结果可视化培训课程

GaussView 分子建模与计算结果可视化培训课程

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  • 培训对象:计算化学用户、分子建模人员、需要快速构建分子模型并可视化Gaussian计算结果的科研工作者。

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  • 培训目标

    1. 掌握GaussView的分子构建工具,能够快速搭建有机分子、配合物、过渡态等复杂结构。

    2. 熟练运用GaussView设置Gaussian计算任务,提交作业并监控运行状态。

    3. 掌握GaussView的可视化功能,分析分子轨道、静电势、振动模式与光谱数据。

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  • 培训内容介绍

    1. GaussView界面导航:熟悉GaussView的主窗口、工具面板、分子列表与显示设置,掌握基本视图操作。

    2. 分子构建基础:使用元素工具、键工具、环工具从零开始构建有机分子,调整键长、键角与二面角。

    3. 高级建模技巧:构建过渡金属配合物,设置配位键;从晶体数据导入结构;构建周期性结构片段。

    4. 对称性设置:检测并设置分子点群,利用对称性简化计算任务。

    5. Gaussian输入文件生成:在GaussView中设置计算任务类型、方法、基组与附加关键词,生成输入文件。

    6. 作业提交与监控:直接提交计算作业到本地或远程队列,监控作业状态,查看输出文件。

    7. 结果导入与浏览:导入Gaussian输出文件(.log、.chk),浏览优化后的结构、能量与频率信息。

    8. 分子轨道可视化:加载格式化检查点文件(.fchk),绘制HOMO、LUMO等分子轨道,设置等值面显示参数。

    9. 静电势表面:生成分子静电势表面,映射静电势值到范德华表面,分析亲电/亲核位点。

    10. 振动模式动画:可视化分子振动模式,制作振动动画,识别特征振动(伸缩、弯曲、扭转)。

    11. 光谱模拟:从频率计算结果生成红外光谱与拉曼光谱图,调整峰形与半峰宽。

    12. 图像与动画输出:导出高质量图像用于论文发表,制作分子振动或反应路径动画用于演示。





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